Les chromosomes de l’embryon proviennent pour moitié de la mère et pour moitié du père. Pour le système immunitaire de la femme, l’embryon est donc un corps étranger. Pour éviter un rejet, des anticorps bloquants le reconnaissent et empêchent le système immunitaire de la femme de l’attaquer. Chez certains couples où la femme est victime de fausses couches à répétition, on a pu montrer que le père et la mère sont porteurs de deux groupes immunologiques très proches. Ainsi, il semblerait que lorsque les deux conjoints sont trop ressemblants, l’organisme de la femme ne fabrique pas ces anticorps bloquants. L’embryon n’étant pas protégé, la fausse couche se produit.